La mayoría de la secuencia estratigráfica varia geoquímicamente de madura a sobre madura (Figura 6). El kerógeno tipo II predomina en la cuenca; sin embargo las muestras podrían ser afectadas por la madurez termal (Figura 7 ). El contenido de materia orgánica de la mayoría de muestras es menor a 2%, aunque algunas muestras de las formaciones La Luna y Aguas Blancas varían entre 2 y 4%. La mayoría de las muestras muestran potencial de hidrocarburos de pobre a bueno, con valores bajo 10 mg HC/g roca.
Basados en los parámetros de calidad de generación HI y S2, las formaciones La Luna y Aguas Blancas muestran las mejores características de roca generadora.